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DOI: 10.1055/s-0038-1639998
Intragenetische DNA Methylierung von PITX1 und lncRNA C5orf66-ASA1 als Biomarker für HNCSS-Patienten
Einleitung:
Gewebebasierte Biomarker können bei der Therapieentscheidung und Nachsorge von Plattenepithelkarzinomen im Kopf-Hals-Bereich (HNSCC) von Vorteil sein. Der Status der Genmethylierung hat sich vor kurzem als prognostischer Biomarker erwiesen. Wir evaluierten den Methylierungstatus der Homöobox PITX1 und der nebenliegenden long intergenic non-coding RNA (lincRNA) C5orf66-AS1.
Material:
Genmethylierungstatus und -expression von 528 Patienten mit HNSCC im Rahmen des Cancer Genome Atlas wurden evaluiert. Methylierung und Expression von PITX1 und lincRNA C5orf66-AS1 wurden mit dem Gesamtüberleben und anderen Parametern verglichen. Folglich wurden zehn Bead-Chips für PITX1 exon 3 und drei Bead-Chip für lincRNA C5orf66-AS1 identifiziert.
Ergebnisse:
Sowohl PITX1 exon 3, als auch lincRNA C5orf66-AS1 waren signifikant mehr methyliert im Tumorgewebe als im angrenzenden gesunden Gewebe (NAT) (exon 3: Tumorgewebe 58.1%, NAT: 31.7%, p < 0.001; lincRNA C5orf66-AS1: Tumorgewebe: 27.4%, NAT: 18.9%, p < 0.001).
In einer univariaten Analyse assoziierten Hypermethylierungen beider Loci signifikant mit dem Überleben (univariate: exon 3: Hazard ratio: 4.97 [1.78 – 16.71], p = 0.010, lincRNA C5orf66-AS1: Hazard ratio: 12.23 [3.01 – 49.74], p < 0.001).
Methylierung von PITX1 exon 3 und lincRNA C5orf66-AS1 korrelieren außerdem signifikant mit der Tumorlokalisation, T-Kategorie, HPV-negativen und p16-negativen Tumoren und dem Grading. Die Kaplan-Meier Analyse zeigte, dass die Hypomethylierung von lincRNA C5orf66-AS1 signifikant mit dem Gesamtüberleben (p = 0,001) der Kohorte assoziiert ist.
Schlussforderung:
Der Methylierungstatus von PITX1 und vor allem von lincRNA C5orf66-AS1 könnte ein vielversprechender prognostischer Biomarker für HNSCC-Patienten sein und somit die Therapieentscheidung beeinflussen.
Publication History
Publication Date:
18 April 2018 (online)
© 2018. The Author(s). This is an open access article published by Thieme under the terms of the Creative Commons Attribution-NonDerivative-NonCommercial-License, permitting copying and reproduction so long as the original work is given appropriate credit. Contents may not be used for commercial purposes, or adapted, remixed, transformed or built upon. (https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/).
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