Intragenetische DNA Methylierung von PITX1 und lncRNA C5orf66-ASA1 als Biomarker für HNCSS-Patienten

Einleitung:

Gewebebasierte Biomarker können bei der Therapieentscheidung und Nachsorge von Plattenepithelkarzinomen im Kopf-Hals-Bereich (HNSCC) von Vorteil sein. Der Status der Genmethylierung hat sich vor kurzem als prognostischer Biomarker erwiesen. Wir evaluierten den Methylierungstatus der Homöobox PITX1 und der nebenliegenden long intergenic non-coding RNA (lincRNA) C5orf66-AS1.

Material:

Genmethylierungstatus und -expression von 528 Patienten mit HNSCC im Rahmen des Cancer Genome Atlas wurden evaluiert. Methylierung und Expression von PITX1 und lincRNA C5orf66-AS1 wurden mit dem Gesamtüberleben und anderen Parametern verglichen. Folglich wurden zehn Bead-Chips für PITX1 exon 3 und drei Bead-Chip für lincRNA C5orf66-AS1 identifiziert.

Ergebnisse:

Sowohl PITX1 exon 3, als auch lincRNA C5orf66-AS1 waren signifikant mehr methyliert im Tumorgewebe als im angrenzenden gesunden Gewebe (NAT) (exon 3: Tumorgewebe 58.1%, NAT: 31.7%, p < 0.001; lincRNA C5orf66-AS1: Tumorgewebe: 27.4%, NAT: 18.9%, p < 0.001).

In einer univariaten Analyse assoziierten Hypermethylierungen beider Loci signifikant mit dem Überleben (univariate: exon 3: Hazard ratio: 4.97 [1.78 – 16.71], p = 0.010, lincRNA C5orf66-AS1: Hazard ratio: 12.23 [3.01 – 49.74], p < 0.001).

Methylierung von PITX1 exon 3 und lincRNA C5orf66-AS1 korrelieren außerdem signifikant mit der Tumorlokalisation, T-Kategorie, HPV-negativen und p16-negativen Tumoren und dem Grading. Die Kaplan-Meier Analyse zeigte, dass die Hypomethylierung von lincRNA C5orf66-AS1 signifikant mit dem Gesamtüberleben (p = 0,001) der Kohorte assoziiert ist.

Schlussforderung:

Der Methylierungstatus von PITX1 und vor allem von lincRNA C5orf66-AS1 könnte ein vielversprechender prognostischer Biomarker für HNSCC-Patienten sein und somit die Therapieentscheidung beeinflussen.

Publication History

Publication Date:
18 April 2018 (online)